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2695分离单元是Alliance系统的基础（包括了溶剂管理和样品管理两部分），再加上其他系统部件便构成完整的系统。随着软件和硬件技术的发展，整个系统的应用领域得到极大的扩展，我们提供了多种仪器选件和附件来配合增长的应用范围。
Alliance系列柱温箱（加热/冷却）和Alliance系列柱温箱（加热）
室温的变化会影响HPLC结果的重现性，无论是单一系统的重复运行间、实验室内的不同系统间，还是不同实验室之间，都可能导致结果的不稳定。柱温变化会造成保留时间漂移、峰形改变、增加得到精密结果的难度。Waters提供2种类型的柱温箱（均是微处理器控制方式），加热/冷却型和加热型。加热/冷却型的温度范围是4℃到65℃，加热型的控温范围是室温上5℃至65℃。这两种柱温箱的尺寸均可以放入30厘米的色谱柱（并包括在线保护柱）。通过可在滑轨上自由定位的夹子固定色谱柱。改进的连接管路和漏液托盘增强其功能和安全性。在柱温箱的底部为切换阀预留了空间。
样品室控温模块
此模块主要用于热不稳定的样品，通过稳定温度来提高样品溶液的稳定性。采用的珀尔帖效应器件大大减小模块尺寸，提供恒定精确的温度控制，控温范围是4℃到40℃。此模块可直接内置于2695中的预留位置。
切换阀选件
提供3种不同的自动切换阀（易安装设计，只需您连接2根电缆，拧紧2个螺丝）。每种阀组件中均包括管路和工具，供您连接到色谱柱或其他外接设备。可通过仪器面板编程控制切换阀，亦可由Empower™或MassLynx™实现软件控制。其中2种Alliance系列切换阀能够自动实现多至3或6根色谱柱的自动切换。可用于多方法序列切换或者是自动方法开发（用于Waters AMDS系统）。另一种2位置切换阀可以用于2根色谱柱的交替切换离线再生（需要一些附加的设备），能够巧妙地增加样品通量。
二进制编码的十进制（BCD）模块
BCD模块通过读取样品瓶上的BCD编码可执行傻瓜式样品样品信息追踪，为非Waters的色谱数据系统提供样品信息。
BCD模块包括电源，2695分离模块连接电缆，25针电缆接口和夹子。25针接口用于BCD模块和数据系统之间的通讯。
GPC功能组件
GPC功能组件使2695分离单元得到运行常温凝胶渗透色谱（GPC）/体积排阻色谱（SEC）的能力，让样品管理系统可以吸取大量的样品进样，同时能够耐受强溶剂。
组件包括2500µL吸样器，2000µL样品环，10mL玻璃注射器，2mL玻璃样品瓶（12x32，100个/包装），一体式PTFE垫片样品瓶盖（100个/包装）。
集成内置式4路溶剂真空脱气机
4路溶剂高性能脱气机组件用于去除HPLC流动相中溶解的空气。此组件可以安装在梯度比例阀所在的托盘上，安装过程非常容易。脱气机能够提高溶剂输送系统的性能，同时提高整个系统的可靠性。
主动式柱塞杆密封圈清洗装置
全自动的清洗系统，可根据流动相选用合适的溶剂，强制清洗泵活塞室高压侧的密封垫圈上的其他溶剂或结晶的盐，同时起到润滑柱塞杆的作用，能够大大增加缓冲液流动相条件下密封圈的寿命。
柱后衍生系统
由柱后衍生模块、温控模块和2个衍生试剂泵组成。使用优化设计的两段式柱后衍生反应器完成在线衍生反应，其中集成了一个独立反应管和技术的逆流热交换器，可以将柱外谱带展宽影响减至并提高仪器的灵敏度。